Bàsicament existeixen dos tipus de sistemes, els sistemes no intensius (oberts o de piles) i els sistemes intensius (tancats o forçats).

Els sistemes no intensius treballen amb piles obertes que es van girant regularment per tal d'airejar-les i així aconseguir que tinguin una quantitat d'oxigen adequada. Per tal de mantenir els valors adequats d'humitat, temperatura i oxigen cal controlar les condicions del procés.

Els sistemes intensius poden treballar dins una nau o utilitzar reactors, com túnels, contenidors, boxes, digestors, sitges, etc.

Aquests darrers sistemes tenen l'avantatge que el procés és totalment controlable, i per tant permet minimitzar la generació de males olors, precisa menys superfície i optimitza l'espai, ja que s'escurcen lleugerament els temps de compostatge.